水利主管機關於公告河川區域線或堤防預定線時，範圍內之土地即受水利法等相關規定限制使用，故分區調整之作業程序僅係依內政部規定將河川區使用分區登記達公示目的，以資明確。且分區調整僅辦理分區之異動，對土地使用地類別並無更動，其不符河川區之使用地編定原則或因應河川管理上需要者，由水利主管機關循適法途徑變更為適當使用地，在未變更編定為適當使用地前，仍受「水利法」及相關法令之限制。